監査をスムーズに受けるにはどうすればよいでしょうか？

大前提として月々の会計処理をしっかりと行っておく必要がございます。また期限ギリギリに動くのではなく、監査法人と事前にどこが問題になりうるかのポイントを抑えておくことをお勧めします。