帰任する年度の所得税申告はどのようにすればよろしいでしょうか。

タックスクリアランスと呼ばれる、通常の確定申告と多少異なる手続きを行う必要があります。税額の計算等は通常の確定申告と同様ですが、個人の所得税を会社が負担している場合には、算出された会社負担の所得税を再度所得として認識して税額を算出します。