還付申告をした際に、税務調査に入られるリスクはありますか？

はい、税務署からの税務調査依頼のリスクはあります。 税務調査を受けてでも還付した方がお金が戻ってくる可能性がある場合には、税務調査を受ける前提で還付申請してもよいかもしれません。