現在当社の会計年度は4月～3月ですが、1月～12月への変更を検討しております。 会計年度変更に伴い､当社及び従業員にとって不利益となるものはありますでしょうか。

会社としては、会計年度の変更がトリガーとなり、税務調査が入る可能性があります。 また、税務調査の結果、追徴課税及びペナルティが発生する恐れはあります。 なお、税務調査は過去直近5年分入られる可能性があります。 一方で、従業員への不利益は特にないかと思います。